Некоторые ключевые отличия между муниципальными автономными и бюджетными учебными заведениями:

1. Финансово-хозяйственная самостоятельность. 2 Бюджетные учреждения более жёстко связаны с соответствующим уровнем бюджета и имеют ограниченную самостоятельность, так как важнейшие вопросы необходимо согласовывать с учредителем. 2 Автономные учреждения располагают широкими правовыми возможностями по управлению учреждением и в отношениях с учредителем. 3
2. Ответственность по обязательствам. 1 Бюджетное учреждение отвечает по своим обязательствам только в объёме денежных средств, находящихся в его распоряжении, а автономное — всем своим имуществом, за исключением недвижимого и особо ценного движимого имущества, закреплённого за ним либо приобретённого за счёт средств собственника. 1
3. Распоряжение имуществом. 1 Бюджетное учреждение не вправе отчуждать либо иным способом распоряжаться имуществом. 1 Автономные учреждения имеют право самостоятельно распоряжаться движимым и недвижимым имуществом организации, которое приобретено за счёт внебюджетных средств. 3
4. Контроль. 1 За деятельностью автономного учреждения предполагается не только государственный, но и общественный контроль. 1
5. Ответственность руководителя. 1 Руководитель автономного учреждения несёт большую ответственность, в частности в размере убытков, причинённых учреждению в результате совершения крупной сделки с нарушением требований закона. 1