Роль метилаз в защите чужеродной ДНК от разрушения заключается в том, что они добавляют метильные группы к адениновым или цитозиновым остаткам в том же сайте, в котором связывается рестрикционный фермент. 2

В результате метилирования сайт становится устойчивым к рестрикции, то есть метилирование защищает ДНК от разрезания. 2

Проникающие в клетку неметилированные молекулы распознаются как чужеродные и разрезаются эндонуклеазами рестрикции. 3 Таким образом, метилазы помогают бактериям отличить свою ДНК от чужеродной по типу её модификации. 13

Этот механизм защиты называется системой рестрикции-модификации. 3