В чем заключается основное отличие тематических программ от комплексных?

Возможно, имелись в виду различия между предметными (тематическими) и комплексными программами.

Предметная (тематическая) программа имеет одну направленность и фокусируется на изучении конкретной темы. studfile.net

Комплексная программа — это совокупность самостоятельных модулей, объединённых по определённому принципу и направленных на решение общих целей и задач. ozerskdtdm.ru www.maam.ru В таких программах ставятся цели и задачи, решение которых невозможно без разнопредметного обучения. ozerskdtdm.ru

Таким образом, основное отличие заключается в том, что тематическая программа ориентирована на изучение одной темы, а комплексная — на соединение различных областей, направлений и видов деятельности в единое целое.