Разница между союзами «несмотря на» и «вопреки» заключается в их значении:

• «Несмотря на» означает «не обращая внимание». 2 Например: «Несмотря на предупредительные выстрелы береговой охраны, корабль продолжил следовать в сторону государственной границы». 2
• «Вопреки» — это «преодолевая сопротивление». 2 Например: «Вопреки воле родителей они поженились». 2

Таким образом, «несмотря на» указывает на то, что действие совершается вне зависимости от чего-либо, а «вопреки» — наперекор чему-либо, преодолевая трудности. 12

Выбор между этими союзами зависит от конкретного контекста предложения.