Разница между сквозной и поглавной нумерацией в научных изданиях заключается в следующем:

1. Сквозная нумерация — это порядковая нумерация элементов издания (заголовков, иллюстраций, таблиц, формул, сносок, выносок) от начала до конца издания. 3
2. Поглавная нумерация — это вид пораздельной нумерации, при которой нумерация параграфов внутри каждой главы своя, новая. 3

Например, при сквозной нумерации по всей работе ставится порядковый номер рисунка: 1, 2, 3 и т. д., кроме приведённых в приложениях. 1 Поглавная нумерация применяется, когда в работе много рисунков: она облегчает проверку иллюстративного материала внутри раздела и исключает путаницу при добавлении в некоторые разделы дополнительных рисунков. 1