Вопросы к Поиску с Алисой
Возможно, имелись в виду различия между загрузчиками UnityBootstrapper и MefBootstrapper, которые являются производными от класса Bootstrapper и реализованы в библиотеке Prism. habr.com www.c-sharpcorner.com
Некоторые возможности загрузчиков, работающих с контейнерами Unity и MEF:
Таким образом, выбор загрузчика зависит от конкретных задач: если в основном нужно разрабатывать расширения для продукта (плагины), то лучше подойдёт загрузчик, работающий с MEF. sonyks2007.blogspot.com Если же нужно просто связать те компоненты, информация о которых известна, то лучше выбрать загрузчик, работающий с Unity. sonyks2007.blogspot.com
Кроме того, в Prism есть загрузчики, работающие с другими контейнерами, например Autofac (AutofacBootstrapper) и StructureMap (StructureMapBootstrapper). sonyks2007.blogspot.com