Разница между приставками пан- и транс- в современном языке заключается в их значениях.
Приставка пан-, греческого происхождения, имеет значение «всеохватывающий», «всеобъемлющий». russkiiyazyk.ru Она указывает, что явление, выраженное второй частью слова, распространяется на всё, на всех, охватывает что-либо в целом. www.oshibok-net.ru Примеры: панславянский, панамериканский, паназиатский, пангенезис. russkiiyazyk.ru
Приставка транс-, латинского происхождения, имеет следующие значения: gramota.ru