Разница между паронимами «двойственный» и «двоякий» заключается в их значениях:

• «Двойственный» — противоречивый, двуличный, касающийся двух сторон, двух участников. 28 Чаще всего употребляется для выражения противопоставления, противоречия. 4
• «Двоякий» — проявляющий себя в двух смыслах, видах. 28 Обычно так называют то, что имеет два смысла, толкования. 4

Таким образом, двойственный описывает что-то, содержащее в себе два различных качества, часто противоречащих друг другу, а двоякий — то, что проявляется в двух видах, формах. 36

Грань между этими словами тонкая, и во многих ситуациях они эквивалентны. 4