Разница между муниципальными автономными и бюджетными школами заключается в следующем:

1. Бюджетные школы финансируются полностью из бюджета города или района. 2 Их учредителем является муниципалитет, который решает, сколько денег выделить на содержание школы, зарплату учителям, учебные материалы и другие расходы. 2
2. Муниципальные автономные образовательные учреждения (МАОУ) также финансируются из бюджета, но имеют большую финансовую самостоятельность. 2 Они могут сами распоряжаться выделенными им средствами, выбирать поставщиков услуг, заключать договоры и управлять своим имуществом. 2

Ещё несколько отличий:

• Бюджетные учреждения более жёстко связаны с соответствующим уровнем бюджета. 1 В отличие от автономных, они практически не получают существенной финансово-хозяйственной самостоятельности, так как важнейшие вопросы необходимо согласовывать с учредителем. 4
• Бюджетное учреждение отвечает по своим обязательствам только в объёме денежных средств, находящихся в его распоряжении. 1 А автономное — всем своим имуществом, за исключением недвижимого, особо ценного движимого имущества, закреплённого за ним либо приобретённого за счёт средств собственника. 1
• Бюджетное учреждение не вправе отчуждать либо иным способом распоряжаться имуществом. 1 Автономное учреждение, в отличие от бюджетного, вправе открывать в установленном порядке счета в кредитных организациях, подлежит обязательной аудиторской проверке и обязано ежегодно публиковать отчёты о своей деятельности. 1