Разница между МАОУ СОШ и другими аббревиатурами школ заключается в обозначении статуса образовательного учреждения или его учредителя: 4

• МАОУ СОШ — муниципальное автономное общеобразовательное учреждение «средняя общеобразовательная школа». 15 Автономные учреждения обладают большей свободой по сравнению с казёнными и бюджетными, в них есть наблюдательный совет, который помогает формировать концепцию развития школы, сотрудничать с разными организациями. 4
• СОШ — средняя общеобразовательная школа. 4 В зависимости от статуса образовательного учреждения или его учредителя к «СОШ» добавляются уточнения. 4
• ГОУ — государственное образовательное учреждение. 4 Сейчас в большинстве случаев ГОУ заменили на ГБОУ, то есть государственное бюджетное образовательное учреждение. 4 Эти школы финансирует государство. 4
• МОУ и МБОУ — муниципальные бюджетные образовательные учреждения, которые финансируют власти города. 4 Такая школа работает за счёт субсидий на содержание имущества и предоставление образовательных услуг. 4
• МКОУ — муниципальное казённое образовательное учреждение. 24 Основное отличие МКОУ в том, что, как и все казённые учреждения, оно обладает минимальными правами, всё имущество школы принадлежит учредителю. 4

Все эти сокращения нужны для корректного и полного наименования школ в официальных документах. 1