Разница между инвагинацией и эпиболией в эмбриогенезе заключается в процессе гаструляции:

1. Инвагинация осуществляется путём впячивания клеточного пласта вегетативной стенки бластулы внутрь бластоцеля (полости дробления). 6 Образуется двуслойный мешок, наружной стенкой которого является первичная эктодерма, а внутренней — первичная энтодерма. 1
2. Эпиболия — это обрастание мелкими клетками анимального полюса более крупных, отстающих в скорости деления и менее подвижных, клеток вегетативного полюса. 15

Таким образом, при инвагинации происходит впячивание одного участка бластодермы внутрь, а при эпиболии — обрастание быстро делящимися клетками (микроклерами) клеток, которые делятся медленнее (макромеров). 4