Разница между фразовыми глаголами get up и wake up заключается в их значении:
Таким образом, wake up используется, когда речь идёт о пробуждении, а get up — когда о том, чтобы подняться на ноги. 1
Также get up употребляется, когда речь идёт об усиливающемся ветре: в этом контексте фразовый глагол переводится как «подниматься», «становиться сильнее». 1