Разница между боковым и верхушечным расположением почек заключается в месте их формирования и функциях.

Верхушечные почки находятся на верхушке побега. 25 Обычно это вегетативные почки, которые образуют только побег, не несущий бутоны (зачаточные цветки). 1 Верхушечная почка обеспечивает рост побега в длину. 45

Боковые (пазушные) почки располагаются на боковых частях побега, чаще в пазухах листа. 12 Такие почки способствуют боковому ветвлению побега, то есть образуют боковые ветки растения. 1

Таким образом, верхушечные почки отвечают за удлинение побега, а боковые — за его ветвление.