Отличие криптозоологии от традиционных наук, таких как зоология и ботаника, заключается в предмете изучения и научном подходе. 12
Криптозоология занимается поиском и изучением животных, существование которых спорно или не доказано наукой. 9 О таких существах рассказывается в легендах, мифах или со слов некоторых «очевидцев» (чупакабра, снежный человек, лох-несское чудовище, драконы, единороги и т. п.). 27
Зоология — наука о представителях царства животных, в том числе человека. 4 Биологи регулярно выявляют новые виды, фиксируют их появление, фотографируют, берут генетический материал, ищут, на кого похож новый вид, кто является его ближайшим родственником и так далее. 1
Ботаника — наука о растениях, в том числе об ископаемых растительных остатках (палеоботаника). 4
Таким образом, главное различие между криптозоологией и зоологией — в том, что криптозоология фокусируется на гипотетических животных, существование которых не подтверждено научным сообществом, в то время как зоология занимается изучением реальных видов животных. 110