Отличие конъюгации у парамеций и бактерий заключается в процессе обмена генетическим материалом:

1. У парамеций во время конъюгации две особи временно соединяются и обмениваются частично или полностью генеративными ядрами (микронуклеусами) и цитоплазмой. 32 В результате меняется генотип и физиологическое состояние особей. 3
2. У бактерий при конъюгации две бактериальные клетки соединяются временным цитоплазматическим мостиком, через который происходит однонаправленный перенос генетического материала (отрезка нити ДНК) от одной бактериальной клетки (донора) к другой (реципиенту). 35 При этом одна особь отдаёт принадлежащую ей генетическую информацию другой особи, не получая ничего взамен. 4