Некоторые отличия геномики от других биологических наук:

• Объект изучения: в отличие от других биологических наук, которые исследуют формы и функции организмов, геномика изучает гены и молекулы, пытаясь воссоздать картину их функционирования в целом организме. 1
• Направление исследований: геномика является обратной генетикой: сначала секвенируют фрагменты генома и потом выясняют, что они кодируют. 2 В отличие от генетики, где исследования направлены от признака к идентификации гена, геномика фокусируется на анализе структуры генома как целого. 25
• Объём изучаемых данных: для геномики характерно использование очень больших объёмов данных. 5
• Использование информационных технологий: в геномике применяются автоматизация, роботизация и создание информационных баз данных, которые обеспечивают сравнительный анализ структур. 2
• Применение специальных методов: для сборки и анализа функции и структуры целых геномов геномика использует высокопроизводительное секвенирование ДНК и биоинформатику. 4