Отличие чистых линий от инбредных заключается в процессе их получения:

• Чистые линии — группа организмов, имеющих определённые признаки, которые полностью передаются потомству в силу генетической однородности всех особей. 12 Например, чистые линии растений — это сорта, при самоопылении дающие генетически идентичное и морфологически сходное потомство. 1
• Инбредные линии получают путём близкородственных скрещиваний в течение нескольких поколений. 15 Для этого используют пару однотипных животных, например брата и сестру, происходящих из одного помёта. 5 Затем из их потомков снова отбирают однотипную пару, которую скрещивают между собой, и так поступают в каждом последующем поколении. 5 Для создания чистой линии необходимо разведение животных по этой схеме на протяжении не менее 20 поколений. 5