Y-хромосома продолжает уменьшаться в размерах у человека из-за того, что она передаётся лишь от отца к сыну. 2 Это значит, что гены в ней не могут комбинироваться, из-за чего накапливаются негативные мутации. 2 С каждым поколением они всё больше приводят к деградации этой хромосомы. 2

С точки зрения эволюции, Y-хромосома уменьшается за счёт сокращения генов в ней. 3 Если нельзя исправить ошибки, не стоит рисковать появлением опасных мутаций в том или ином гене. 3 Поэтому сегодня Х-хромосома человека кодирует как минимум 700–1000 белков, а Y — всего 55. 1

За всё время существования Homo sapiens его Y-хромосома уже потеряла 1393 из 1438 изначально имевшихся в ней генов, и этот процесс продолжается. 2