Корень глагола «прийти» состоит из одной буквы «й» из-за исторических изменений в слове. 15
В древнерусском языке начальная форма глагола звучала как «ити». 5 В дальнейшем к ней присоединилась согласная «д» после корня «и» — «идти». 5 Но в однокоренных словах с различными приставками буква «и» заменилась на «й», а «д» исчезла: «выйти», «уйти», «зайти» и «прийти». 5
В 1956 году, когда унифицировали русскую орфографию, из трёх существующих написаний выбрали «прийти» для единообразия корня в начальной форме всех приставочных глаголов. 5