В ДНК содержится тимин, а в РНК — урацил, по следующим причинам:

• В ДНК тимин присутствует для уменьшения количества мутаций. 1 Цитозин, общий для ДНК и РНК, легко подвергается дезаминированию, то есть потере аминогруппы (NH₂). 1 Если бы в этой молекуле всегда был урацил, было бы сложно понять, где реальный урацил, а где видоизменённый цитозин. 1 Специализированный фермент удаляет весь урацил из молекулы, восполняя пробелы «правильным» цитозином. 1
• В РНК урацил присутствует из-за энергетической выгодности. 2 Для синтеза урацила как неметилированного основания уходит значительно меньше энергии, чем для синтеза метилированного основания — тимина. 2 Кроме того, молекулы РНК присутствуют в клетке в виде множества копий и «живут» сравнительно недолго, распадаясь после выполнения своей функции. 5 Поэтому спонтанный гидролиз цитозина не так опасен для РНК, как для ДНК. 5