Тимин в ДНК замещается урацилом в РНК из-за различий в структуре и функциях этих нуклеиновых кислот. 3
В РНК урацил присутствует вместо тимина из-за энергетической выгодности: для синтеза урацила как неметилированного основания уходит значительно меньше энергии, чем для синтеза тимина, который является метилированным. 1
В ДНК, в свою очередь, тимин используется вместо урацила из-за механизма репарации дезаминированного цитозина. 1 Превращение цитозина в урацил происходит чаще всего спонтанно и является спонтанной мутацией. 1 Если бы в составе ДНК был урацил, было бы невозможно различить мутантную пару от канонической, и мутации бы интенсивно накапливались. 1 Тимин же имеет своеобразный маркер — метильную группу, что делает возможной репарацию ДНК. 1
Также предполагается, что первыми полинуклеотидами, появившимися в ходе биологической эволюции, были молекулы РНК, и лишь на какой-то более поздней стадии эволюционного процесса для целей долговременного хранения генетической информации появились химически более стабильные молекулы ДНК, и, следовательно, замена урацила на тимин в ДНК, возможно, была одним из эволюционных приобретений организмов, стабилизирующих их геном. 2