Температура плавления ДНК зависит от соотношения GC-пар, потому что пара нуклеотидов GC образована тремя водородными связями, а пара AT — только двумя. 14

Это делает пару GC более энергетически устойчивой, поэтому чем больше таких пар в ДНК, тем выше температура её плавления. 1

Кроме того, спаривание оснований цитозин/гуанин обычно сильнее, чем спаривание оснований аденин/тимин, что также влияет на температуру плавления: более высокие температуры связаны с высоким содержанием GC. 3