Северную зелёную анаконду сложно отличить от южной зелёной анаконды по морфологии, так как они выглядят настолько похожими, что даже эксперты не могут отличить их друг от друга. 2

Однако генетические различия между видами очевидны: северный вид зелёных анаконд отделился от южной зелёной анаконды почти 10 миллионов лет назад, и генетически они различаются на 5,5%. 25 При этом ядерная ДНК не смогла показать измеримых различий между двумя видами. 3

Также северные зелёные анаконды располагаются в более жаркой климатической зоне, и их рацион питания является более разнообразным, чем у южных сородичей. 1

Таким образом, основные различия между видами заключаются в генетических особенностях, а морфологические показатели у них схожи.