РНК-полимераза способна к абортивной транскрипции, потому что соединение первых 10 нуклеотидов — неэффективный процесс. 1 Поэтому транскрипция на этой стадии часто обрывается, короткий транскрипт высвобождается и синтез начинается снова. 1

Механизм абортивной инициации предполагает, что РНК-полимераза остаётся неподвижной, а она раскручивает и тянет вниз ДНК в комплексе транскрипции, проходя через нуклеотиды полимеразного активного сайта, тем самым расшифровывая ДНК без движения. 23 Это приводит в размотанной ДНК к накапливанию фермента, отсюда и название «морщины ДНК». 2

Степень прерывистой инициации зависит от присутствия факторов транскрипции и силы промоторных контактов. 4