Возникновение синергетического эффекта в природе происходит благодаря объединению потенциалов двух или более структур. 1 Если свойства удачно дополняют друг друга, то в объединённой системе общий потенциал будет больше, чем сумма прежде используемых потенциалов. 14

Также синергия возникает при утилизации энтропии совместно действующих процессов в системе. 3 Энтропия отдельно взятого процесса передаётся элементам других процессов и обеспечивает дополнительный выход, формирующий синергию процессов системы. 3

Ещё одна причина возникновения синергетического эффекта — неравновесность в системе, которая является источником появления новой организации (порядка). 5

Таким образом, синергия порождается системами, состоящими из структур, в которых протекают и взаимодействуют друг с другом процессы под управлением механизмов. 1