Некоторые причины, по которым некоторые участки ДНК остаются неактивными в эухроматине:

• Посадка нуклеосом на определённые последовательности ДНК. 4 Это делает их недоступными для взаимодействия с другими ДНК-связывающими белками, что играет важную роль в регуляции активности генов. 4
• Факультативный гетерохроматин. 25 Это инактивированные и конденсированные участки хромосом, которые могут обратимо переходить из эухроматинового в гетерохроматиновое состояние в зависимости от типа клетки, стадии клеточного цикла или особенности одной из гомологичных хромосом. 5

Таким образом, локализация гена в эухроматине является необходимым, но недостаточным условием для его экспрессии. 1