Некоторые причины, по которым некоторые слова пишутся по правилу «чу-щу», а другие — нет:

• Аббревиатуры. 1 В них допустимы любые сочетания букв, кроме тех, которые в начале слова стоять не могут. 1 Пример — аббревиатура ЧЮ, которая расшифровывается как «чувство юмора». 1
• Сложносокращённые слова. 1 Если первая часть слова оканчивается на букву Ч, а вторая часть начинается с буквы Ю, то в таком слове будет буквосочетание ЧЮ. 1
• Литовские фамилии. 1 По традиции все литовские фамилии или имена, которые в оригинале оканчиваются на -čius, по-русски транслитерируются именно как -ЧЮС. 1

Также исключениями могут быть слова, которые пришли в русский язык из других языков. 3 Например, слова «жюри» и «парашют» написаны с буквой Ю. 3 Но таких слов-исключений очень мало, их написание запоминают как словарные слова. 3