Пролин разрушает формирование спиралей в белках из-за своей циклической структуры. 2 Она не позволяет сформировать правильную регулярную α-спираль. 2

Атом азота в остатке пролина не может участвовать в образовании водородной связи. 2 Более того, вносимые пролином искажения в структуру спирали препятствуют формированию водородной связи с атомом азота следующего остатка. 2 Таким образом, в месте расположения пролина происходит выпадение двух водородных связей, стабилизирующих структуру α-спирали. 2

В результате возникает участок раскрученности молекулы, не имеющий правильной периодической пространственной организации. 1 В этой области пептидная цепь может сравнительно легко изменять свою конформацию в отличие от жёстких конформаций α-спирали и β-структуры. 1