Микроорганизмы ротовой полости разнообразны из-за большого выбора мест обитания. 1 Во рту есть мягкие ткани (десны, язык, щёки или нёбо), твёрдая ткань зубов, области, недоступные атмосферному кислороду (протоки слюнных желёз), и жидкая фаза — слюна, в которой могут жить неприкрепляющиеся планктонные микроорганизмы. 1

Благоприятные условия для развития бактерий также способствуют разнообразию микрофлоры ротовой полости. 3 В этой части тела всегда стоит равномерная влажность и температура (примерно 37 °С), обилие питательных веществ, достаточное содержание кислорода, наличие складок в полости рта, межзубных промежутков и десневых карманов, слабощелочная pH провоцируют размножение различных бактерий. 3