Большинство третичных структур белков термостабильны благодаря наличию различных связей, которые удерживают их форму: 45

• Ковалентные связи (дисульфидные мостики) формируются между двумя цистеиновыми остатками. 45
• Ионные связи между боковыми группами аминокислотных заряженных остатков. 45
• Водородные связи. 45
• Гидрофильно-гидрофобные связи. 45 При взаимодействии с окружающими молекулами воды белковая молекула стремится приобрести такую форму, чтобы неполярные белковые группы оказались изолированными от водного раствора, а на поверхности белковой молекулы оказывались полярные гидрофильные боковые группы. 45

Кроме того, свернутый в нативное состояние белок обычно имеет более низкую свободную энергию Гиббса, чем развёрнутая конформация, что также способствует термостабильности. 1