Археи выделяют в отдельное царство, несмотря на общие черты с бактериями, из-за важных структурных и биохимических отличий. 1

У них разные метаболические процессы, есть реакции, которые могут осуществлять только археи, например, образование метана из углекислоты и водорода. 1 Также у них отличаются аппарат синтеза белка, клеточная стенка, липиды и мембраны. 1

Впервые археи были выделены в качестве отдельной группы прокариот в 1977 году Карлом Вёзе и Джорджем Эдвардом Фоксом при сравнительном анализе 16S рРНК. 2 Деление прокариот на археи и истинные бактерии было предложено американским биологом К. Везе в 1980 году на основании различий в структуре генома, свидетельствующих о раннем расхождении этих групп организмов в ходе эволюции. 3