Роль факторов транскрипции в регуляции синтеза белка заключается в том, что они регулируют активность генов путём изменения скорости и интенсивности транскрипции. 15

Общая схема регуляции на стадии транскрипции следующая: эффектор связывается с регуляторным белком и меняет его способность влиять на регуляторные элементы ДНК. 1 В зависимости от вида регуляторного белка это приводит либо к ускорению построения мРНК и, следовательно, усилению синтеза белка, либо, наоборот, к прекращению этих процессов. 1

Также регуляция возможна за счёт изменения активности каждого фактора по отдельности и создания уникальных сочетаний белковых факторов в условиях, требующих изменения интенсивности синтеза или спектра образуемых белков. 1

Таким образом, факторы транскрипции позволяют поддерживать баланс разнообразных белков в клетке или организме, изменять этот баланс в меняющихся условиях окружающей или внутриорганизменной среды, а также обеспечивать смену белков в процессах клеточной дифференцировки и развития организма. 5