Вопросы к Поиску с Алисой
«Скучать» — общеславянское слово, образованное от «скука», которое восходит к «кукати» — «горевать». sanstv.ru lexicography.online
«Кукати», в свою очередь, восходит к звукоподражательному «ку» (присутствующему, например, в слове «кукушка»), которое первоначально имело значение «кричать». sanstv.ru lexicography.online
Таким образом, с позиции этимологии, «я по тебе скучаю» означает «я по тебе плачу, горюю». vk.com