Двоякодышащие рыбы имеют следующее значение для экосистемы водоёмов:

• Поддерживают баланс экосистемы. 1 Они являются ключевыми звеньями пищевых цепей и помогают контролировать популяции других организмов. 2
• Поддерживают чистоту водоёмов и улучшают среду обитания. 1 Рыбы способствуют очищению воды и улучшению качества среды обитания. 1
• Участвуют в круговороте веществ. 1 Их присутствие важно для сохранения биологического разнообразия. 1
• Служат пищей для различных хищников. 1

Кроме того, в засушливые периоды двоякодышащие рыбы способны зарываться в ил и там пережидать время осушения водоёма, используя только лёгочное дыхание. 5