Значение эффекта основателя в эволюции человека заключается в том, что он влияет на генетический состав популяций и может ускорить эволюционные изменения, приводя к появлению новых видов или особых адаптаций. 3

Когда малая группа особей отрывается от основной популяции и основывает новую, они несут с собой лишь часть исходного генетического разнообразия. 3 В результате генетическое разнообразие новой популяции оказывается сниженным и смещённым по сравнению с исходной. 3

Например, самое большое генетическое разнообразие наблюдается у африканцев — своего рода исходной популяции. 1 У всех остальных генофонд менее разнообразен, что говорит о наличии единого предка, вышедшего из Африки. 1

Также эффект основателя имеет значение для оценки путей расселения древних людей, а также степени родства между современными популяциями или народами. 5