Некоторые современные методы молекулярной систематики:

• ДНК-штрихкодирование. 3 Для идентификации и классификации видов используют короткие стандартизированные последовательности ДНК в определённом гене. 3 Идентификацию проводят путём сравнения неизвестных последовательностей со штрих-кодами ДНК известных видов. 3
• Использование молекулярных маркеров. 3 Это последовательности ДНК, по которым можно найти схожие участки у родственных видов. 3 К таким маркерам относятся, например, микросателлитные локусы, случайно амплифицированная полиморфная ДНК (RAPD), полиморфизм длины рестрикционных фрагментов и другие. 3
• Интегративная таксономия. 3 Для определения видовой принадлежности организма используют молекулярные, экологические, морфологические и поведенческие данные. 3
• Методы, базирующиеся на анонимном полиморфизме ДНК. 2 К ним относятся RFLP, RAPD, AFLP, DAF, SCAR, CAPS и другие. 2 Такие методы дают портрет всего генома и подходят для анализа родственных отношений между близкородственными таксонами или внутривидового разнообразия. 2
• Методы сравнения последовательности ДНК определённых фрагментов. 2 К ним относится секвенирование. 2 Такой метод незаменим для анализа родственных отношений более высоких таксономических категорий (вид, род, семейство). 2

Выбор молекулярного метода зависит от объекта исследования и поставленной научной задачи. 2