Некоторые методы изучения фермент-субстратного комплекса:
Разностный Фурье-метод. dl.booksee.org Позволяет установить структуру комплекса, когда связывание лиганда не сопровождается сильными изменениями в структуре или упаковке молекул фермента в кристалле. dl.booksee.org Метод состоит в выявлении различий между рентгенограммами исходных кристаллов белка и этих же кристаллов, пропитанных раствором лиганда. dl.booksee.org
Рентгеноструктурный анализ. elib.oreluniver.ru www.chem21.info Даёт обширную информацию о фермент-субстратных взаимодействиях при исследовании кристаллических ферментов и их комплексов с ингибиторами и субстратами. www.chem21.info Найденные этим способом координаты атомов фермента и субстрата затем оптимизируются путём минимизации энергетических потенциалов. www.chem21.info
Получение стабильных комплексов. dl.booksee.org Например, можно связать определённую часть молекулы субстрата с ферментом и установить структуру остальной части путём построения модели. dl.booksee.org Также можно использовать аналог субстрата, в котором модифицирована реакционноспособная связь. dl.booksee.org
Исследование в условиях, при которых ферментативная реакция не протекает. dl.booksee.org Для этого используют медленно реагирующие субстраты при определённых значениях рН или при очень низких температурах, либо химически модифицированный фермент. dl.booksee.org
Примеры полезных ответов Поиска с Алисой на вопросы из разных сфер. Вопросы сгенерированы нейросетью YandexGPT для актуальных тем, которые определяются на базе обобщённых запросов к Поиску с Алисой.