Какие существуют методы анализа и реконструкции филогении в биологии?

Некоторые методы анализа и реконструкции филогении в биологии:

• Классический метод на основе сравнительной анатомии. bsu.bio Принцип: потомки наследуют некоторые существенные черты предкового вида. bsu.bio Эти устойчиво наследуемые черты можно выявить и использовать в качестве диагностических признаков группы. bsu.bio
• Молекулярно-генетический анализ. bsu.bio В основе модели «молекулярных часов» лежит допущение, что количество различий, которые накапливаются в последовательностях белков или нуклеиновых кислот, прямо пропорционально времени, прошедшему с момента их дивергенции. bsu.bio
• Метод матрицы расстояний. biomolecula.ru Его основа — расчёт попарных различий между соответствующими генами всех видов, участвующих в таком анализе. biomolecula.ru Гены каждого анализируемого вида сравниваются по каждой позиции нуклеотидов, и чем больше найдено отличий, тем больше будет «расстояние» между видами. biomolecula.ru
• Метод максимального правдоподобия. biomolecula.ru www.researchgate.net Для расчёта кладограммы, помимо последовательности ДНК, надо выбрать модель замены нуклеотидов, на основании которой будут рассчитываться вероятности. biomolecula.ru Также в расчёт берётся длина ветви или эволюционная дистанция между двумя таксонами. biomolecula.ru
• Байесовский вывод. biomolecula.ru Он похож на метод максимального правдоподобия, поскольку также основывается на модели и длине ветвей. biomolecula.ru Но отличие Байесовского вывода в том, что тут берётся в расчёт ещё один фактор — апостериорная вероятность, которая рассчитывается на основании как исходных данных, так и полученных результатов анализа. biomolecula.ru

Каждый из этих методов имеет свои преимущества и недостатки, и выбор метода зависит от типа данных и целей исследования. www.progkids.com