Какие преимущества и недостатки использования вырожденных праймеров?

Преимущества использования вырожденных праймеров:

• Более точное отображение разнообразия микробиома при анализе сложных образцов микроорганизмов с высоким генетическим разнообразием. www.frontiersin.org Это необходимо, когда требуется амплифицировать многочисленные неизвестные целевые последовательности. www.frontiersin.org
• Возможность случайного мутагенеза. elib.gsu.by После ПЦР с вырождёнными праймерами образуется набор мутантных штаммов с различными нуклеотидными заменами в специфическом сайте. elib.gsu.by В результате происходят разные аминокислотные замены, и могут случайно синтезироваться белки с полезными свойствами. elib.gsu.by

Недостатки использования вырождённых праймеров:

• Большая вероятность неспецифической амплификации или образования димера праймера. www.frontiersin.org Это может снизить эффективность и точность ПЦР. www.frontiersin.org Однако проблему можно решить путём соответствующей обработки последовательных считываний, так как длину ожидаемого ампликона можно точно предсказать и учесть в настройках фильтра. www.frontiersin.org