Какие преимущества и недостатки имеет секвенирование следующего поколения в пищевой промышленности?

Некоторые преимущества секвенирования следующего поколения (NGS) в пищевой промышленности:

• Возможность определять микробное сообщество непосредственно в образцах пищи. 1 Это важно для определения безопасности и качества продукта. 1
• Идентификация и характеристика патогенов пищевого происхождения. 5 В том числе тех, которые обладают резистентностью к антибиотикам и неблагоприятным технологическим воздействиям. 5
• Создание электронных баз данных. 5 Это позволяет оценить пути циркуляции в среде обитания человека наиболее опасных возбудителей, научно обосновать меры профилактики пищевых инфекций. 5

Некоторые недостатки NGS в пищевой промышленности:

• Необходимость в значительных вычислительных мощностях. 1 Для обработки множественных результатов, полученных на платформах NGS, требуются гигабайты памяти на жёстком диске. 1
• Высокая частота ошибок. 4 Это связано с тем, что технологии NGS обеспечивают короткие длины считывания. 4
• Трудоёмкость. 4 Применение технологий NGS для секвенирования крупных, сложных и часто богатых повторами геномов требует тщательно продуманных стратегий сборки и сложных аппаратных ресурсов. 4