Какие преимущества и недостатки имеет секвенирование следующего поколения в пищевой промышленности?

Некоторые преимущества секвенирования следующего поколения (NGS) в пищевой промышленности:

• Возможность определять микробное сообщество непосредственно в образцах пищи. fptt.ru Это важно для определения безопасности и качества продукта. fptt.ru
• Идентификация и характеристика патогенов пищевого происхождения. www.voprosy-pitaniya.ru В том числе тех, которые обладают резистентностью к антибиотикам и неблагоприятным технологическим воздействиям. www.voprosy-pitaniya.ru
• Создание электронных баз данных. www.voprosy-pitaniya.ru Это позволяет оценить пути циркуляции в среде обитания человека наиболее опасных возбудителей, научно обосновать меры профилактики пищевых инфекций. www.voprosy-pitaniya.ru

Некоторые недостатки NGS в пищевой промышленности:

• Необходимость в значительных вычислительных мощностях. fptt.ru Для обработки множественных результатов, полученных на платформах NGS, требуются гигабайты памяти на жёстком диске. fptt.ru
• Высокая частота ошибок. annalsmicrobiology.biomedcentral.com Это связано с тем, что технологии NGS обеспечивают короткие длины считывания. annalsmicrobiology.biomedcentral.com
• Трудоёмкость. annalsmicrobiology.biomedcentral.com Применение технологий NGS для секвенирования крупных, сложных и часто богатых повторами геномов требует тщательно продуманных стратегий сборки и сложных аппаратных ресурсов. annalsmicrobiology.biomedcentral.com