Некоторые основные проблемы, которые возникают при обработке сложных математических моделей:

• Неполнота информации об исследуемом процессе. 1 Возникает необходимость рассмотрения различных моделей, учитывающих основные закономерности изучаемого явления для разных диапазонов основных параметров. 1
• Несоответствие решений на разных уровнях. 2 Погрешности измерений, отсутствие ряда замеров и неполнота информации по используемым моделям приводят к тому, что решения, получаемые на разных уровнях, не соответствуют друг другу. 2
• Сложная система нелинейных соотношений. 3 Её трудно записать без ошибок математическими выражениями на бумаге или на компьютере. 3
• Высокая вероятность возникновения ошибок. 3 При увеличении числа агентов в модели вероятность ошибок стремительно растёт. 3
• Неправильный учёт комплексных взаимодействий. 3 Некоторые взаимодействия описываются несколькими переменными, и в отсутствие автоматизированной поддержки управления переменными невозможно выполнять работу без серьёзных ошибок. 3

Для преодоления трудностей при обработке сложных математических моделей могут использоваться современные системы компьютерной алгебры, которые позволяют автоматически повторять цикл выкладок после модификации модели, упрощать систему соотношений модели и проверять корректность размерности переменных в соотношениях. 3