Какие методы используются для секвенирования генома растений?

Некоторые методы, которые используются для секвенирования генома растений:

• Секвенирование по Сэнгеру. sciencejournals.ru sites.icgbio.ru Этот метод активно применялся в 2000-е годы, он позволил определить последовательности полных геномов ряда важных сельскохозяйственных растений, в том числе риса, кукурузы и сои. sciencejournals.ru Однако секвенирование по Сэнгеру характеризуется высокой стоимостью, трудозатратностью и низкой продуктивностью. sciencejournals.ru
• Методы секвенирования нового поколения (NGS). sciencejournals.ru Эти методы позволяют генерировать миллионы и миллиарды коротких высокоточных прочтений за один запуск прибора. sciencejournals.ru К ним относятся, например, платформы 454, SOLiD, Ion Torrent/Proton, Illumina, BGI. sciencejournals.ru
• Технологии секвенирования третьего поколения. sciencejournals.ru Эти методы определяют последовательности единичных молекул длиной до миллиона нуклеотидов, что имеет ключевое значение для получения высококачественных сборок геномов. sciencejournals.ru
• Целевое (таргетное) секвенирование. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru Метод заключается в выделении и секвенировании определённой области генома. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru Основным преимуществом такого подхода считают высокую мощность обнаружения и более высокое разрешение. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru
• Экзомное секвенирование. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru Метод секвенирования только белок-кодирующих участков генов. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru Позволяет секвенировать участки генома, которые обогащены функциональными вариантами и демонстрируют низкий уровень содержания повторяющихся областей. www.researchgate.net vavilov.elpub.ru