Какие методы используются для секвенирования генома вирусов?

Некоторые методы, которые используются для секвенирования генома вирусов:

• Секвенирование нового поколения (NGS). eniivi.niivirom.ru Это передовой метод с высокой производительностью, который позволяет получать большие объёмы информации о последовательностях геномов. eniivi.niivirom.ru Для NGS используют, например, платформы Illumina, SOLiD, Oxford Nanopore и MGI. eniivi.niivirom.ru
• Полногеномное секвенирование (WGS). microbius.ru Это процесс секвенирования и сборки микробного генома интересующего организма. microbius.ru Для WGS применяют технологии секвенирования второго (например, Illumina) или третьего поколения (PacBio или Nanopore). microbius.ru
• Секвенирование по методу «дробовика». microbius.ru В этом процессе ДНК или РНК выделяют непосредственно из представленного клинического образца. microbius.ru Выделенная ДНК или РНК проходит через подготовку библиотеки и затем секвенируется. microbius.ru
• Метагеномное секвенирование. www.rmj.ru Этот метод используют для устранения фонового микробиома в образцах от инфицированных людей. www.rmj.ru С его помощью можно быстро идентифицировать вирус и другие патогены. www.rmj.ru
• Метод ОТ-ПЦР. www.rmj.ru Его применяют при детекции вирусной РНК. www.rmj.ru
• Опосредованная транскрипцией амплификация (ТМА). www.rmj.ru Это запатентованная технология изотермической амплификации с одной пробиркой. www.rmj.ru ТМА смоделирована на основе репликации ретровирусов и имеет более высокую чувствительность, чем ОТ-ПЦР. www.rmj.ru