Фосфофруктокиназа выполняет следующие функции в метаболизме:

• Катализирует фосфорилирование фруктозо-6-фосфата в процессе гликолиза, перенося фосфатную группу от АТФ к фруктозо-6-фосфату. 25 Это один из ключевых элементов гликолиза. 2
• Лимитирует скорость распада глюкозы. 1 Особенно важна эта функция в тех случаях, когда глюкозо-6-фосфат образуется за счёт распада гликогена. 1
• Является регуляторным ферментом. 1 Активность фосфофруктокиназы активируется АМФ, который связывается с регуляторным центром и увеличивает его сродство к фруктозо-6-фосфату. 1 Подавляет активность фермента повышенный уровень АТФ, а также цитрат. 1