Азотистые основания и сахар в структуре нуклеотида взаимодействуют следующим образом: первый атом углерода пентозы связан с азотистым основанием (связь C-N), а пятый — с фосфорной кислотой (фосфоэфирная связь: C-O-P). 3

Сахар в нуклеозидах соединён с азотистым основанием гликозидной связью. 1 Как правило, это N-гликозидная связь — между аминогруппой (или другой группой, содержащей атом азота) с сахаром. 1

Соединение сахара с основанием происходит с выделением молекулы воды, то есть представляет собой реакцию конденсации. 5 Для образования нуклеотида требуется ещё одна реакция конденсации — между сахаром и фосфорной кислотой. 5