Аппарат Гольджи на рисунке выглядит как стопка дискообразных мембранных мешочков (цистерн), несколько расширенных ближе к краям, и связанная с ними система пузырьков Гольджи. 3

В растительных клетках обнаруживается ряд отдельных стопок (диктиосомы), в животных клетках часто содержится одна большая или несколько соединённых трубками стопок. 3

В оптический микроскоп аппарат Гольджи представляет собой сетку или изогнутые палочкообразные тельца, лежащие вокруг ядра. 47

Под электронным микроскопом эта органелла представлена тремя видами образований: 47

• Сплющенные дискообразные цистерны в виде многоярусной системы, которые плотно располагаются пучками на расстоянии от 14 до 25 нм с внутренним пространством от 5 до 20 нм. 4 Обычно в одном комплексе находится 5–6 мешочков. 4
• Система трубочек диаметром 20–50 нм. 47
• Система пузырьков (везикул) — размеры мелких пузырьков — 20–30 нм, больших — до 2000 нм. 47