Наличие пролина и глицина влияет на формирование вторичной структуры белков следующим образом:
- Пролин формирует жёсткий изгиб (кинк) в белковой цепи. 5 Например, в коллагене такие кинки обеспечивают формирование тугой тройной белковой спирали. 5 Белки с высоким содержанием пролина имеют низкую степень спирализации, так как он резко меняет направление полипептидной цепи. 4
- Глицин позволяет основной белковой цепи иметь в этом месте максимальную подвижность. 2 Глицин часто встречается в элементах вторичной структуры, называемых «поворотами», где полипептидная цепь делает крутой поворот на 180 градусов. 2
Таким образом, белок, в котором преобладают пролин и глицин, может иметь вторичную структуру сильно вытянутой левозакрученной спирали. 1 Например, это характерно для коллагена, полипептидные цепи которого на 2/3 состоят из пролина и глицина и закручены влево. 1