Системный подход повлиял на развитие научного познания несколькими способами:

• Выявление более широкой познавательной реальности. 14 Понятия и принципы системного подхода позволяют обнаружить познавательную реальность, которая шире той, что фиксировалась в прежнем знании. 14 Например, с помощью системного подхода появилось понятие биосферы в концепции В. И. Вернадского, биогеоценоза в современной экологии, оптимальный подход в экономическом управлении и планировании. 14
• Разработка новых схем объяснения. 14 В рамках системного подхода создаются схемы объяснения, в основе которых лежит поиск конкретных механизмов целостности объекта и выявление типологии его связей. 14
• Объединение отдельных наук в единую науку. 2 Системный подход — форма методологической интеграции современной науки, при которой открытия в рамках конкретных наук быстро становятся достоянием всей науки. 2
• Возможность усматривать пробелы в знаниях. 2 Системный подход даёт возможность обнаруживать неполноту знаний об объекте, определять задачи научных исследований, в отдельных случаях предсказывать свойства отсутствующих частей описания. 2
• Создание новых научных отраслей. 3 Многие новые научные отрасли призваны изучать специфические виды отношений между объектами, например, кибернетика, ориентированная на работу в области управления. 3