Как различается частота встречаемости кодонов в разных организмах?

Частота встречаемости кодонов в разных организмах различается: в разных организмах выбор частых и редких синонимичных кодонов различен. ru.ruwiki.ru sciencejournals.ru Это явление называют предпочтением кодонов. ru.ruwiki.ru

Несколько факторов, которые влияют на различия в частоте встречаемости кодонов:

• Мутационные паттерны. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org У разных организмов и в разных частях одного генома они различаются. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org Некоторые кодоны в большей степени подвержены мутациям и поэтому встречаются реже. ru.ruwiki.ru
• Уровень экспрессии гена. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org Часто функционально связанные гены, с большой вероятностью экспрессирующиеся на одном уровне, имеют одинаковые кодонные предпочтения. ru.ruwiki.ru
• GC-состав генома. ru.ruwiki.ru web.archive.org В некоторых случаях по GC-составу можно даже предсказать частоту использования кодонов. web.archive.org
• Образ жизни организма. genomebiology.biomedcentral.com Например, организмы, способные жить в широком диапазоне сред обитания, демонстрируют высокую степень предвзятости в использовании кодонов. genomebiology.biomedcentral.com

На частоту встречаемости кодонов также влияет репертуар тРНК организма. genomebiology.biomedcentral.com Специфичный для данного организма выбор кодона соответствует различиям в популяциях и концентрациях тРНК, узнающих данные кодоны. sciencejournals.ru