Топоизомеразы действуют путём создания временного однонитевого или двунитевого разрыва в молекуле ДНК, проведения сквозь разрыв другого, целого сегмента цепи и воссоединения цепи в месте разрыва. bsu.bio В результате такого ферментативного акта целостность цепей сохраняется, но их топологическое состояние может измениться. bsu.bio
Топоизомеразы делятся на два типа в зависимости от механизма действия: ru.ruwiki.ru
- Топоизомеразы I. ru.ruwiki.ru Вносят одноцепочечные разрывы без затрат энергии. ru.ruwiki.ru Механизм действия: остаток аминокислоты тирозина осуществляет нуклеофильную атаку фосфатной группы ДНК, образуя фосфотирозин. ru.ruwiki.ru Фермент связывается с высвободившимся 3'- или 5'-концом цепи. ru.ruwiki.ru Топоизомеразы IA-типа связываются с 5'-концом и снимают только отрицательную суперспирализацию, а топоизомеразы IB-типа связываются с 3'-концом и снимают как положительную, так и отрицательную суперспирализацию. ru.ruwiki.ru
- Топоизомеразы II. ru.ruwiki.ru Осуществляют АТФ-зависимое расщепление обеих цепей ДНК с последующим переносом цепей через разрыв и его лигированием. ru.ruwiki.ru Разрыв происходит из-за связывания тирозинов топоизомеразы с ДНК с образованием двух 5'-фосфодиэфирных связей. ru.ruwiki.ru В образовавшийся разрыв проходит другая двуцепочечная ДНК. ru.ruwiki.ru Таким образом, число положительных или отрицательных супервитков изменяется на 2 (а не на 1, как у топоизомераз I). ru.ruwiki.ru